Fonn kom fra velferdsdelen i Forsvaret da han overtok kontorsjefjobben i Kommunale Kinematografers Landsforbund (KKL) i 1964. Han tok straks opp arbeidet med omlegging av kinopolitikken her i landet, nemlig å avskaffe den svært tyngende statlige fornøyelsesavgiften på kinobilletter. Da Stortinget endelig opphevet denne, opprettet KKL sitt fond i 1970 basert på en frivillig avgift på 2,6 prosent av omsetningen, som så vel kommunale som private kinoer betalte inn. Avgiften ble til lov i 1987 og inkluderte da også videogram.

Egil Fonn ble KKLs og Norsk kino- og filmfonds første direktør. Ikke mange år etter så Norges første filmfestival dagens lys i Drøbak, Den norske filmfestivalen ble senere permanent lagt til Haugesund. Fonn hadde også stor interesse for internasjonale spørsmål gjennom europeiske organisasjoner.

Han var også mangeårig redaktør av landets eldste filmtidsskrift Film & Kino. Fonn sto for en langsiktig og klok forvaltning av offentlige midler som mang en leder i offentlig sektor i dag kunne ha ett og annet å lære av.